Fódlan világát három hatalmas birodalom uralja. Középen helyezkedik el Garreg Mach kolostora, Fódlan legfontosabb vallásának, a Seiros egyházának, valamint Seiros Lovagjainak otthona. Az egyház nem csak arra törekszik, hogy a kontinens egészén fenntartsa a rendet, hanem a kolostor az előkelő Tiszti Akadémiának is otthont ad. Azok, akik itt tanulnak, egyszer Fódlan jövőjének sorsát tarthatják majd kezükben.
Utazó zsoldosként kezded történetedet, egy csoport tagjaként, amit apád vezet. Miután egy váratlan esemény során rejtett képességeid napfényre kerülnek, felkérnek, hogy legyél a Tiszti Akadémia három háza valamelyikének professzora. Ezzel egy időben egy titokzatos lány, Sothis is egyre többször bukkan fel álmaidban...
Az akadémiai feladatok során tanulóiddal stratégiai, fordulóalapú ütközetekben kell próbára tennetek magatokat Fódlan világában. A sorozat történetében most először, egységeidet egész alakulatok követik, és támogatják őket a csatatéren. Az, hogy tanulóid élnek vagy halnak, a te vezetői képességeiden múlik, úgyhogy készen kell állnod a küzdelmek során stratégiád adaptálására a kihívásokhoz, mert csak így vezetheted seregeidet győzelemre.
Bontakoztasd ki tanulóid tehetségét, és segíts nekik, hogy a lehető legjobbakká váljanak a Tiszti Akadémián. Mozogj szabadon a Garreg Mach kolostorban tanórák között, végezz el feladatokat, és ismerd meg jobban a tanulókat, hogy kapcsolatotokat erősítsd és értékes információkhoz juss.
A legeslegelső feladatod a Tiszti Akadémián az lesz, hogy eldöntsd a három nemesi ház melyikében kívánsz tanítani. Ezen házak diákjai más és más képességekkel és személyiséggel bírnak, és mindhárom házat egy-egy uralkodói sarj képviseli a három fódlani birodalomból.
Professzorként vezetned kell majd tanulóidat akadémiai életük során és a csatatéren egyaránt, így különösen fontos, hogy bölcsen válassz házat!
Ebben a házban az Adrestiai Birodalom diákjai tanulnak, köztük a vezetőjük, a jövőbeli császár, Edelgard is. A ház diákjai különösen erős mágiai képességeikről híresek.
E ház ad otthont a Faerghus Szent Királyságából származó diákoknak, élükön Dimitri herceggel. A diákok kiemelkedő harcművészeti tehetségükről ismertek.
Ez a ház a Leicester Szövetség diákjait tömöríti magába, akiket a vezető nemesi család örököse, Claude vezet. Sok diák e házban lenyűgöző távlövészeti tudományáról híresült el.
A kiadásban megtalálható egy művészeti album, egy SteelBook®, zenei válogatást tartalmazó USB pendrive, a három házat bemutató kitűzőkészlet, valamint a Fire Emblem: Three Houses játékkártyája.